神社の娘、日暮かごめは神社のほこらにある古びた枯れ井戸から戦国時代へとタイムスリップしてしまう。かごめは、半妖の犬夜叉と運命的な出会いを果たし、あらゆる願いがかなうと言われている“四魂の玉”を巡る戦いと陰謀に巻き込まれていくことになる…。